MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli SMS-3-5 plasmid pSMS35_8

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010485	AAT	2	6	7	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010485	TTAT	2	8	27	34	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010485	AACAT	2	10	39	48	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_010485	AATA	2	8	58	65	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010485	ATT	2	6	73	78	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010485	TTA	2	6	93	98	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010485	T	6	6	131	136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010485	A	6	6	153	158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010485	ATC	2	6	194	199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010485	CTGA	2	8	570	577	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_010485	AACC	2	8	598	605	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_010485	A	7	7	613	619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010485	ACA	2	6	638	643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010485	CA	3	6	3120	3125	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_010485	GCA	2	6	3545	3550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010485	GAT	2	6	3577	3582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010485	AGT	2	6	3611	3616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010485	CTG	2	6	3664	3669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010485	T	6	6	3739	3744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010485	GCA	2	6	3754	3759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010485	A	7	7	3772	3778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010485	AAG	2	6	3786	3791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010485	AGA	3	9	3834	3842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010485	TCCC	2	8	3857	3864	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
25	NC_010485	TA	3	6	3876	3881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010485	CAA	2	6	3896	3901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010485	A	6	6	3927	3932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010485	AT	3	6	3971	3976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010485	TA	4	8	5946	5953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010485	TA	3	6	5965	5970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010485	CGC	2	6	5984	5989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_010485	A	7	7	6039	6045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010485	CCAC	2	8	6049	6056	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
34	NC_010485	TGA	2	6	6607	6612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010485	GCA	2	6	7156	7161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010485	CAA	2	6	7177	7182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010485	C	7	7	7183	7189	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
38	NC_010485	GAC	2	6	7277	7282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010485	T	8	8	7291	7298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010485	CGC	2	6	7362	7367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_010485	CTT	2	6	7478	7483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010485	TTC	2	6	7492	7497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010485	GGC	2	6	7710	7715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010485	GAA	2	6	7809	7814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010485	A	7	7	7867	7873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010485	ATT	2	6	7923	7928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010485	A	6	6	7951	7956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010485	A	6	6	8016	8021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010485	AAC	2	6	8044	8049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010485	CAA	2	6	8065	8070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010485	T	6	6	8094	8099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010485	AT	3	6	8113	8118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010485	GAA	3	9	8133	8141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010485	CAA	2	6	8209	8214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010485	TTC	2	6	8236	8241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010485	A	6	6	8268	8273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010485	CAA	2	6	8460	8465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010485	GTA	2	6	8522	8527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010485	C	6	6	8570	8575	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
60	NC_010485	TCA	2	6	8577	8582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010485	CTGA	2	8	8605	8612	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_010485	TGA	2	6	8625	8630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010485	TAA	2	6	8635	8640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010485	ATAAA	2	10	8665	8674	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010485	TAAA	2	8	8729	8736	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010485	TTGC	2	8	8737	8744	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_010485	A	7	7	8754	8760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010485	AAG	2	6	8818	8823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010485	C	7	7	8839	8845	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
70	NC_010485	G	6	6	8852	8857	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010485	ATC	2	6	8889	8894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.